Софора японская в последние годы стала широко использоваться как лечебное средство как в народной, так и в научной медицине. В народной медицине настойку плодов софоры применяют наружно как ранозаживляющее средство при глубоких ранениях, трофических язвах.
Во внутрь, эту настойку назначают при гипертонической болезни, язвенной болезни, внутренних кровотечениях. Настойку также применяют при лечении экземы, абсцессов. Отвар соцветий софоры применяют во внутрь при лечении гипертонической болезни, сахарного диабета.
В современной научной медицине настойку цветков и плодов софоры японской применяют как ранозаживляющее средство.
Оксиматрин, выделенный из софоры японской обладает антиоксидантными, противовоспалительными и кардиопротективными свойствами.
Генистеин, извлеченный из листьев софоры оказывает антиостеопорозное воздействие, ингибирует процесс дифференцирования преадипоцитов в адипоциты, тем самым предупреждая развитие ожирения.